Posted by on 6 lipca 2018

Zobacz ilustrację S7 w Dodatkowym dodatku dla ilustracji wyników dla dziewięciu regionów dla wszystkich pięciu grup glejaków. Zobacz Tabela S6 w Dodatku Uzupełniającym, aby uzyskać pełne zestawienie danych dla wszystkich 22 ocenianych SNP. Oceniliśmy powiązania pomiędzy pięcioma grupami glejaka i dziewięcioma regionami, które uprzednio wykazano w badaniach asocjacji genomu ze związanymi z ryzykiem glejaka: TERC (3q26), TERT (5p15), EGFR (7p12, zawierający dwa niezależne regiony), CCDC26 ( 8q24), CDKN2A lub CDKN2B (określane dalej jako CDKN2A / B) (9p21), PHLDB1 (11q23), TP53 (17p13) i RTEL1 (20q13) (Figura 4 i fig. S7 i tabela S5 w dodatkowym dodatku) .10-14 Co najważniejsze, SNP CCDC26 (rs55705857) wiązało się ze zwiększonym ryzykiem rozwoju dowolnego glejaka z mutacjami IDH. SNP PHLDB1 (rs498872) był związany z glejakami z tylko mutacjami IDH. TERP (rs1920116), TERT (rs2736100) i RTEL1 (rs6010620) SNP były ochronne wobec glejaków z tylko mutacjami TERT. SNP CDKN2A / B (rs4977756) wiązało się ze zwiększonym ryzykiem zarówno potrójnie negatywnych glejaków, jak i glejaków z tylko mutacjami TERT. SNP TP53 (rs78378222) było związane ze zwiększonym ryzykiem glejaków z mutacjami TERT i IDH. SNP CCDC26 i TERT były również związane ze zwiększonym ryzykiem glejaków dróg oddechowych (Tabela S6 i sekcja Wyniki w dodatkowym dodatku).
Dyskusja
Pomimo intensywnych wysiłków zmierzających do scharakteryzowania cech biologicznych molekularnych glejaka, 1,2,16,17,19,20 w praktyce nie ma prostego sposobu wiarygodnego kategoryzowania pacjentów z glejakiem w grupach klinicznie i etiologicznie podobnych. Zdefiniowaliśmy grupy a priori oparte na obecności lub nieobecności mutacji promotora TERT, mutacji IDH i kodowania 1p / 19q. W wyniku klasyfikacji pacjentów w jednej z pięciu grup poszerzamy wcześniejsze obserwacje, które zostały oparte na typie histologicznym, stopniu złośliwości, mutacji IDH i kodowaniu 1p / 19q.3,15 Stwierdziliśmy spójne związki między grupami molekularnymi a wiekiem przy diagnozie przeżycie, wzorce nabytych zmian i warianty linii płciowej w trzech zestawach danych. Ta konsystencja jest godna uwagi, biorąc pod uwagę różne metody oceny przypadku, które zostały użyte w trzech różnych seriach, które analizowaliśmy (przypadki w badaniu Glejaka dla dorosłych u dorosłych były oparte na populacji i klinice, przypadki z Kliniki Mayo były oparte na odesłaniach, a przypadki z projektu TCGA wybrano głównie na podstawie wielkości guza). Sieć badawcza Atlas genomu nowotworu3 niezależnie zidentyfikowała podobne grupy, wykorzystując nienadzorowane analizy skupień mutacji DNA, ekspresji RNA, liczby kopii DNA i danych dotyczących metylacji DNA.
Potrójnie dodatnie glejaki są najsilniej związane z oligodendralnym typem histologicznym, mniejszym allelem SNP rs55705857 (8q24) i lepszym ogólnym przeżyciem. Jeśli przyjmie się, że prawie wszystkie glejaki z kodowaniem 1p / 19q mają mutacje w TERT i IDH, najnowsze dane z grupy Oncology Radiation Therapy sugerują, że guzy takie będą miały większe korzyści z chemioterapii i radioterapii adiuwantowej.15 Guzy te są genomicznie ciche w stosunku do tych w innych grupach (tj. mają niewiele dodatkowych nabytych zmian innych niż kodowanie 1p / 19q, mutacja promotora TERT i mutacja IDH). Około połowa z tych nowotworów nie ma mutacji CIC i FUBP1, ale to, czy CIC i FUBP1 są zmienione przez inne mechanizmy, czy też inne geny supresorowe guza na 1p i 19q nabywają mutacje, pozostaje jeszcze do ustalenia. Ta grupa i grupa z tylko mutacjami TERT mają wysoką częstość występowania utraty chromosomu 4 i nabytych mutacji PIK3CA lub PIK3R1; jednak wiek rozpoznania, przeżycie całkowite i związki wariantów linii płciowej różnią się między tymi dwiema grupami. Eksperymentalne modele potrójnie dodatnich glejaków powinny pogłębić naszą wiedzę o dynamicznych związkach między wariantami linii płciowej, strukturą chromatyny, mutacją IDH, utrzymaniem telomerów i chemosensywnością.
Wśród osób dorosłych z glejakami osoby z guzami, które mają tylko mutacje IDH, mają najwcześniejszy średni wiek (37 lat) i rokowanie pośrednie; stanowią również połowę wszystkich pacjentów, którzy mają glejaki ze składnikiem oligodendrogleju i dwie trzecie tych, u których występują gwiaździaki stopnia II lub III. Guzy te prawie zawsze nabywają mutacje w TP53 i ATRX. Na podstawie ich jednolitego profilu mutacyjnego glejaki z tylko mutacjami IDH stają się ważną grupą do eksperymentalnego modelowania i nowatorskiego odkrywania terapeutycznego.
Glejaki z tylko mutacjami TERT to głównie glejaki stopnia IV; jednak 39 z 406 (9,6%) w naszym badaniu miało stopień II lub III
[patrz też: niacynamid, laserowe obkurczanie pochwy, wzorcowanie przyrządów pomiarowych ]

Powiązane tematy z artykułem: laserowe obkurczanie pochwy niacynamid wzorcowanie przyrządów pomiarowych

Posted by on 6 lipca 2018

Zobacz ilustrację S7 w Dodatkowym dodatku dla ilustracji wyników dla dziewięciu regionów dla wszystkich pięciu grup glejaków. Zobacz Tabela S6 w Dodatku Uzupełniającym, aby uzyskać pełne zestawienie danych dla wszystkich 22 ocenianych SNP. Oceniliśmy powiązania pomiędzy pięcioma grupami glejaka i dziewięcioma regionami, które uprzednio wykazano w badaniach asocjacji genomu ze związanymi z ryzykiem glejaka: TERC (3q26), TERT (5p15), EGFR (7p12, zawierający dwa niezależne regiony), CCDC26 ( 8q24), CDKN2A lub CDKN2B (określane dalej jako CDKN2A / B) (9p21), PHLDB1 (11q23), TP53 (17p13) i RTEL1 (20q13) (Figura 4 i fig. S7 i tabela S5 w dodatkowym dodatku) .10-14 Co najważniejsze, SNP CCDC26 (rs55705857) wiązało się ze zwiększonym ryzykiem rozwoju dowolnego glejaka z mutacjami IDH. SNP PHLDB1 (rs498872) był związany z glejakami z tylko mutacjami IDH. TERP (rs1920116), TERT (rs2736100) i RTEL1 (rs6010620) SNP były ochronne wobec glejaków z tylko mutacjami TERT. SNP CDKN2A / B (rs4977756) wiązało się ze zwiększonym ryzykiem zarówno potrójnie negatywnych glejaków, jak i glejaków z tylko mutacjami TERT. SNP TP53 (rs78378222) było związane ze zwiększonym ryzykiem glejaków z mutacjami TERT i IDH. SNP CCDC26 i TERT były również związane ze zwiększonym ryzykiem glejaków dróg oddechowych (Tabela S6 i sekcja Wyniki w dodatkowym dodatku).
Dyskusja
Pomimo intensywnych wysiłków zmierzających do scharakteryzowania cech biologicznych molekularnych glejaka, 1,2,16,17,19,20 w praktyce nie ma prostego sposobu wiarygodnego kategoryzowania pacjentów z glejakiem w grupach klinicznie i etiologicznie podobnych. Zdefiniowaliśmy grupy a priori oparte na obecności lub nieobecności mutacji promotora TERT, mutacji IDH i kodowania 1p / 19q. W wyniku klasyfikacji pacjentów w jednej z pięciu grup poszerzamy wcześniejsze obserwacje, które zostały oparte na typie histologicznym, stopniu złośliwości, mutacji IDH i kodowaniu 1p / 19q.3,15 Stwierdziliśmy spójne związki między grupami molekularnymi a wiekiem przy diagnozie przeżycie, wzorce nabytych zmian i warianty linii płciowej w trzech zestawach danych. Ta konsystencja jest godna uwagi, biorąc pod uwagę różne metody oceny przypadku, które zostały użyte w trzech różnych seriach, które analizowaliśmy (przypadki w badaniu Glejaka dla dorosłych u dorosłych były oparte na populacji i klinice, przypadki z Kliniki Mayo były oparte na odesłaniach, a przypadki z projektu TCGA wybrano głównie na podstawie wielkości guza). Sieć badawcza Atlas genomu nowotworu3 niezależnie zidentyfikowała podobne grupy, wykorzystując nienadzorowane analizy skupień mutacji DNA, ekspresji RNA, liczby kopii DNA i danych dotyczących metylacji DNA.
Potrójnie dodatnie glejaki są najsilniej związane z oligodendralnym typem histologicznym, mniejszym allelem SNP rs55705857 (8q24) i lepszym ogólnym przeżyciem. Jeśli przyjmie się, że prawie wszystkie glejaki z kodowaniem 1p / 19q mają mutacje w TERT i IDH, najnowsze dane z grupy Oncology Radiation Therapy sugerują, że guzy takie będą miały większe korzyści z chemioterapii i radioterapii adiuwantowej.15 Guzy te są genomicznie ciche w stosunku do tych w innych grupach (tj. mają niewiele dodatkowych nabytych zmian innych niż kodowanie 1p / 19q, mutacja promotora TERT i mutacja IDH). Około połowa z tych nowotworów nie ma mutacji CIC i FUBP1, ale to, czy CIC i FUBP1 są zmienione przez inne mechanizmy, czy też inne geny supresorowe guza na 1p i 19q nabywają mutacje, pozostaje jeszcze do ustalenia. Ta grupa i grupa z tylko mutacjami TERT mają wysoką częstość występowania utraty chromosomu 4 i nabytych mutacji PIK3CA lub PIK3R1; jednak wiek rozpoznania, przeżycie całkowite i związki wariantów linii płciowej różnią się między tymi dwiema grupami. Eksperymentalne modele potrójnie dodatnich glejaków powinny pogłębić naszą wiedzę o dynamicznych związkach między wariantami linii płciowej, strukturą chromatyny, mutacją IDH, utrzymaniem telomerów i chemosensywnością.
Wśród osób dorosłych z glejakami osoby z guzami, które mają tylko mutacje IDH, mają najwcześniejszy średni wiek (37 lat) i rokowanie pośrednie; stanowią również połowę wszystkich pacjentów, którzy mają glejaki ze składnikiem oligodendrogleju i dwie trzecie tych, u których występują gwiaździaki stopnia II lub III. Guzy te prawie zawsze nabywają mutacje w TP53 i ATRX. Na podstawie ich jednolitego profilu mutacyjnego glejaki z tylko mutacjami IDH stają się ważną grupą do eksperymentalnego modelowania i nowatorskiego odkrywania terapeutycznego.
Glejaki z tylko mutacjami TERT to głównie glejaki stopnia IV; jednak 39 z 406 (9,6%) w naszym badaniu miało stopień II lub III
[patrz też: niacynamid, laserowe obkurczanie pochwy, wzorcowanie przyrządów pomiarowych ]

Powiązane tematy z artykułem: laserowe obkurczanie pochwy niacynamid wzorcowanie przyrządów pomiarowych