Posted by on 28 maja 2018

To badanie wykazało, że mutacja leży w ewolucyjnie konserwowanym regionie w obrębie linii ssaków. Następnie zbadaliśmy częstość występowania mutacji w różnych populacjach ludzkich i genotypowaliśmy osoby z czterech grup zdrowych osób z różnych grup etnicznych, z których każda reprezentowała populacje z głównych kontynentów: 138 białych holenderskich przodków (Europa), 99 osób z Tanzanii ( Afryka), 100 Chińczyków Han (Azja) i 105 Indian Trio (rdzenni Amerykanie) z Surinamu (Ameryka Południowa). Dectin-1 został całkowicie zsekwencjonowany w populacji holenderskiej, a Tyr238X był jedyną niesynonimiczną mutacją zidentyfikowaną. Holenderska populacja miała częstotliwość alleli 0,069, a populacja Tanzanii 0,035; wszystkie osoby z mutacją były heterozygotami. Mutacja była nieobecna w populacjach z Chin i Surinamu. Ten wariant został zarejestrowany w bazie danych dbSNP, jako rs16910526. Ryc. 3. Ryc. 3. Polimorfizmy i haplotypy mutacji stop Dectin-1 na całym świecie. Częstotliwość polimorfizmu dectin-1 rs16910526 jest pokazana dla różnych populacji świata. Przodkowy allel A prowadzi do funkcjonalnego receptora dectin-1, podczas gdy wyprowadzony allel C prowadzi do mutacji kodonu wczesnego zatrzymania i niefunkcjonalnego receptora dectin-1. Wyprowadzony allel występuje tylko w populacjach z Afryki i zachodniej Eurazji. Największe rozpowszechnienie mutacji (prawie 40%) stwierdzono w populacji San w Afryce Południowej.
Human Human Diversity Wybór przeglądarki projektu został wykorzystany do uzyskania dalszych informacji na temat częstotliwości i rozmieszczenia światowego SNP; analiza ta potwierdziła nasze wyniki (ryc. 3). Przeanalizowaliśmy różnorodność haplotypów w obrębie białej populacji i czarnej populacji badając zestawy danych SNP dla genomewidu dla próbek uzyskanych od 1422 białek z Wielkiej Brytanii 1958 urodzinowej kohorty13 i 171 afrykańskich Maasai z Kinyawa, Kenia (z HapMap Phase III) .14 Częstotliwości alleli polimorfizm w obu populacjach nie różnił się znacząco od obserwowanych wcześniej (biel, 0,078 i czerń, 0,023, jak zmierzono w naszych populacjach) 13. Analiza minimalnej sieci mutacji wykazała, że spośród 23 haplotypów występujących w obu populacjach tylko 2 zawierają mutacja stop (rysunek SB w dodatkowym dodatku). Oba haplotypy występują zarówno w populacjach europejskich, jak i afrykańskich, a zatem nie są specyficzne dla populacji. Ponadto haplotypy znajdują się w pobliżu pradawnego haplotypu w sieci, co wskazuje, że są one blisko spokrewnione ze starożytnym haplotypem (rysunek S5C w dodatkowym dodatku).
Dyskusja
Wadliwa ekspresja powierzchni dektyny-1 z powodu polimorfizmu Tyr238X powoduje brak rozpoznawania .-glukanów i osłabioną odpowiedź cytokinową przez monocyty i makrofagi, ale normalne zabijanie C. albicans przez neutrofile. Dane te pokazują ważną rolę szlaków .-glukan-dektyna-1 dla prawidłowej aktywacji odpowiedzi cytokinowej23, ale także pokazują nadmiarowy charakter dektyny-1 w fagocytozie i zabicie Candida albicans. Zwykła funkcja neutrofili u osób, u których nie występuje funkcja dectin-1, zapewnia ochronę przed inwazyjną infekcją grzybiczą
[hasła pokrewne: firmy sprzątające, kabiny toaletowe, szorowarki ]

Powiązane tematy z artykułem: firmy sprzątające kabiny toaletowe szorowarki

Posted by on 28 maja 2018

To badanie wykazało, że mutacja leży w ewolucyjnie konserwowanym regionie w obrębie linii ssaków. Następnie zbadaliśmy częstość występowania mutacji w różnych populacjach ludzkich i genotypowaliśmy osoby z czterech grup zdrowych osób z różnych grup etnicznych, z których każda reprezentowała populacje z głównych kontynentów: 138 białych holenderskich przodków (Europa), 99 osób z Tanzanii ( Afryka), 100 Chińczyków Han (Azja) i 105 Indian Trio (rdzenni Amerykanie) z Surinamu (Ameryka Południowa). Dectin-1 został całkowicie zsekwencjonowany w populacji holenderskiej, a Tyr238X był jedyną niesynonimiczną mutacją zidentyfikowaną. Holenderska populacja miała częstotliwość alleli 0,069, a populacja Tanzanii 0,035; wszystkie osoby z mutacją były heterozygotami. Mutacja była nieobecna w populacjach z Chin i Surinamu. Ten wariant został zarejestrowany w bazie danych dbSNP, jako rs16910526. Ryc. 3. Ryc. 3. Polimorfizmy i haplotypy mutacji stop Dectin-1 na całym świecie. Częstotliwość polimorfizmu dectin-1 rs16910526 jest pokazana dla różnych populacji świata. Przodkowy allel A prowadzi do funkcjonalnego receptora dectin-1, podczas gdy wyprowadzony allel C prowadzi do mutacji kodonu wczesnego zatrzymania i niefunkcjonalnego receptora dectin-1. Wyprowadzony allel występuje tylko w populacjach z Afryki i zachodniej Eurazji. Największe rozpowszechnienie mutacji (prawie 40%) stwierdzono w populacji San w Afryce Południowej.
Human Human Diversity Wybór przeglądarki projektu został wykorzystany do uzyskania dalszych informacji na temat częstotliwości i rozmieszczenia światowego SNP; analiza ta potwierdziła nasze wyniki (ryc. 3). Przeanalizowaliśmy różnorodność haplotypów w obrębie białej populacji i czarnej populacji badając zestawy danych SNP dla genomewidu dla próbek uzyskanych od 1422 białek z Wielkiej Brytanii 1958 urodzinowej kohorty13 i 171 afrykańskich Maasai z Kinyawa, Kenia (z HapMap Phase III) .14 Częstotliwości alleli polimorfizm w obu populacjach nie różnił się znacząco od obserwowanych wcześniej (biel, 0,078 i czerń, 0,023, jak zmierzono w naszych populacjach) 13. Analiza minimalnej sieci mutacji wykazała, że spośród 23 haplotypów występujących w obu populacjach tylko 2 zawierają mutacja stop (rysunek SB w dodatkowym dodatku). Oba haplotypy występują zarówno w populacjach europejskich, jak i afrykańskich, a zatem nie są specyficzne dla populacji. Ponadto haplotypy znajdują się w pobliżu pradawnego haplotypu w sieci, co wskazuje, że są one blisko spokrewnione ze starożytnym haplotypem (rysunek S5C w dodatkowym dodatku).
Dyskusja
Wadliwa ekspresja powierzchni dektyny-1 z powodu polimorfizmu Tyr238X powoduje brak rozpoznawania .-glukanów i osłabioną odpowiedź cytokinową przez monocyty i makrofagi, ale normalne zabijanie C. albicans przez neutrofile. Dane te pokazują ważną rolę szlaków .-glukan-dektyna-1 dla prawidłowej aktywacji odpowiedzi cytokinowej23, ale także pokazują nadmiarowy charakter dektyny-1 w fagocytozie i zabicie Candida albicans. Zwykła funkcja neutrofili u osób, u których nie występuje funkcja dectin-1, zapewnia ochronę przed inwazyjną infekcją grzybiczą
[hasła pokrewne: firmy sprzątające, kabiny toaletowe, szorowarki ]

Powiązane tematy z artykułem: firmy sprzątające kabiny toaletowe szorowarki